硅藻土中的硅藻有很多不一样的形状，如圆盘状、针状、筒状、羽状等。松散密度为0.3～0.5g/cm3,莫氏硬度为1～1.5(硅藻骨骼微粒为4.5～5mm)，孔隙率达80～90%，能吸收其自身分量1.5～4倍的水，是热、电、声的不良导体，熔点1650～1750°c，化学稳定性高，除溶于氢氟酸以外，不溶于任何强酸，但能溶于强碱溶液中。
硅藻土的氧化硅多数是非晶体，碱中可溶性硅酸含量为50～80%。非晶型sio2加热到800～1000°c时变为晶型，碱中可溶性硅酸可削减到20～30%。1.5矿产特性硅藻土是一种具有生物构造的岩石。首要由80～90%，有的达90%以上的硅藻壳构成。海水、湖水中的氧化硅的首要耗费者即是硅藻，构成硅藻软泥。在成岩过程中经石化期间形成硅藻土。硅藻壳由蛋白石构成，硅藻在成长繁衍过程中，汲取水中胶态二氧化硅，并逐渐转变为蛋白石。
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